El Museo Diocesano colabora con instituciones públicas y privadas en diversas actividades: conferencias, conciertos, talleres didácticos, visitas guiadas…

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Consejería de Educación y Cultura del Gobierno de Cantabria.

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Fundación Caja Cantabria y Liberbank,

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Fundación Comillas,

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Fundación Santillana,

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Fundación Botin,

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Fundación ONCE.

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Ayuntamientos de Cantabria,

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Festival Internacional de Santander…